Baza Danych Ligandów Bialek

Niniejsza praca stanowi opis zrealizowanych przez autora projektów dotycz cych zagadnienia wspomaganego komputerowo projektowania leków. Projekty b d ce tematem pracy to baza danych ligandów bia ek LIGANSdb oraz program do analizy rozk adu oddzia ywa w bia ku o nazwie PDP 1.0 (Potencial Density In Protein). LIGANDSdb to serwis internetwy dost pny pod adresem LIGANDSdb posiada dwa rodzaje przeszu-kiwania zasobów: przeszukiwanie po nazwach bia ek dostarczaj ce listy ligandów, które wi si z dan protein oraz przeszukiwanie po nazwach ligandów którego rezultatem jest lista bia ek, do których dany ligand si wi e. Dodatkowo przy ka dym bia ku za czona jest informacja o pe nionej funkcji biologicznej oraz o kodzie EC bia ka je eli kod taki posiada. Serwis ten powsta w oparciu o baz danych PDB, a konkretnie w oparciu o ok. 25 tys. struktur kompleksów bia ko ligand. PDP 1.0 to program do analizy rozk adów oddzia ywa w bia ku z naciskiem na ob-szar miejsca wi cego ligand.